É mais fácil e mais rápido instalar o sistema operacional pelo pendrive, alguns computadores mais antigos não conseguem dar boot pelo pendrive, mas os mais recentes todos vão conseguir o boot, facilitando a vida de quem vai fazer a instalação do windows.
Para você instalar o Windows pelo pendrive você vai precisar de:
1º Um pendrive com pelo menos 4Gb de espaço.
2º O arquivo .iso do windows que você quer instalar.
Caso você tenha o CD/DVD, é possível criar o ISO dele utilizando o BurnAware, veja aqui onde baixar e como usar.
Para quem possui o serial original do windows é possível baixar o ISO diretamente da Microsoft.
3º Windows 7 USB DVD Tool
Quando tiver com o ISO e com o programa da microsoft em mão é simples, abra o programa, selecione onde está o ISO e clique em next posteriormente selecione o pendrive.
Aguarde o programa terminar o processo de cópia e está pronto seu pendrive bootavel.
Agora basta dar boot no computador que deseja instalar pelo pendrive, você pode alterar na BIOS o boot, definindo o pendrive como primário, ou pode apertar F12 logo após ligar o computador que em algumas placas mães vai aparecer um menu de boot, com as opções de CD/HD/Pendrive e o que mais você tiver disponível para boot.